转基因玉米是世界上最重要的转基因作物之一。目前种植的转基因玉米，以瑞士诺华和美国孟山都公司共同开发的Bt转基因玉米为主。Bt转基因玉米是为提高玉米抗病虫害能力而培育的，其培育方法是向玉米种子中植入一种芽孢杆菌的基因，这种芽孢杆菌可以有效地杀伤危害玉米的害虫螟蛾。这种转基因玉米分泌的物质在两天内就能消灭99%的螟蛾幼虫，而目前最好的杀虫剂至少也要用6天的时间。

　　美国科学家还培育出能抗欧洲玉米螟的转基因玉米，以防欧洲玉米螟威胁玉米种植。此外，抗根瘤线虫病的玉米新品种也已研制成功，2~3年内即可大规模栽培。除美国外，欧盟的西班牙和法国也已开始种植转基因Bt玉米，德国也有小面积的Bt玉米种植。中国农业大学生物学院朱登云博士后率领的国家“高蛋白质、高赖氨酸转基因玉米自交系和杂交组合的选育”课题组,经过7年研究将马铃薯花粉上的一个基因转入玉米,结果赖氨酸和蛋白质比常规玉米含量分别提高30%、90%,攻克了国际上一直没有攻克的难题。

　　还有一些新的转基因玉米品种已经出现或正在研究，他们分别是：

　　低植酸玉米。由于动物难以消化传统玉米中的存在不溶性植酸，而将其直接排出体外，这些排泄物有时会造成环境问题。如用低植酸玉米制成饲料，饲料中的钙和蛋白质可更安全地被动物吸收，从而可减少造成污染问题的氮排泄物的数量。低植酸玉米在美国已经商业化。

　　高植酸酶玉米。饲料中植酸酶含量高可使牲畜粪便中磷酸盐含量减少一半左右，进而保护土壤。

　　高赖氨酸、高蛋氨酸、高苏氨酸玉米。用高赖氨酸、高蛋氨酸、高苏氨酸玉米制成的饲料有助于禽畜改善主要氨基酸的平衡，减少动物对氮的排出量。