台湾省农委会负责关于农业生物技术和动植物quarantine的评论和监督，有一个生物研究委员会给COA提供有关GMOs的指导方针和立法，它包括来自环境保护局，健康部和国家科学委员会以及一些大学的代表。
        行政院卫生署主要负责监控和管理食品安全。

        台湾省并没有专门的GMO产品的法规。
        台湾食品SANITATION法，在1995年制定，提供了食品相关法规的框架，新的法规在2000年末实施，这项法律与日本的非常相似。
        对GMO在动植物方面的研究的田间试验法规（1998）要求研究仅可以在COA批准的实验点，温室和实验室进行。对rDNA实验的指导方针由台湾省农委会准备并于2000年实施，它们同美国国家健康研究院和疾病控制中心的指导方针相似。